MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 27916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013203	T	7	7	261	267	0 %	100 %	0 %	0 %	257783815
2	NC_013203	TTG	2	6	272	277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783815
3	NC_013203	ACCA	2	8	286	293	50 %	0 %	0 %	50 %	257783815
4	NC_013203	A	7	7	299	305	100 %	0 %	0 %	0 %	257783815
5	NC_013203	AAC	2	6	316	321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783815
6	NC_013203	TGC	2	6	339	344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783815
7	NC_013203	ATG	2	6	359	364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783815
8	NC_013203	GCA	2	6	373	378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783815
9	NC_013203	GTT	2	6	385	390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783815
10	NC_013203	TTG	2	6	392	397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783815
11	NC_013203	TGA	2	6	423	428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783815
12	NC_013203	TCAT	2	8	512	519	25 %	50 %	0 %	25 %	257783815
13	NC_013203	AGA	2	6	642	647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783815
14	NC_013203	TTA	2	6	659	664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783815
15	NC_013203	CAA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783815
16	NC_013203	CGT	2	6	775	780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783815
17	NC_013203	AAG	2	6	815	820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783815
18	NC_013203	GAA	2	6	826	831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783815
19	NC_013203	CAAT	2	8	853	860	50 %	25 %	0 %	25 %	257783815
20	NC_013203	CAG	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783815
21	NC_013203	TC	3	6	951	956	0 %	50 %	0 %	50 %	257783815
22	NC_013203	TC	3	6	1002	1007	0 %	50 %	0 %	50 %	257783815
23	NC_013203	AG	3	6	1024	1029	50 %	0 %	50 %	0 %	257783815
24	NC_013203	AAT	2	6	1053	1058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257783815
25	NC_013203	GAT	2	6	1326	1331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783816
26	NC_013203	TC	3	6	1406	1411	0 %	50 %	0 %	50 %	257783816
27	NC_013203	GCT	2	6	1416	1421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783816
28	NC_013203	TCTTAC	2	12	1442	1453	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257783816
29	NC_013203	TCT	2	6	1458	1463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783816
30	NC_013203	ACT	2	6	1476	1481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783816
31	NC_013203	CTC	2	6	1492	1497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257783816
32	NC_013203	A	6	6	1519	1524	100 %	0 %	0 %	0 %	257783816
33	NC_013203	GTT	2	6	1542	1547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783816
34	NC_013203	GAA	2	6	1590	1595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
35	NC_013203	ACA	2	6	1601	1606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783816
36	NC_013203	CT	3	6	1633	1638	0 %	50 %	0 %	50 %	257783816
37	NC_013203	GAA	2	6	1641	1646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
38	NC_013203	TTCAA	2	10	1653	1662	40 %	40 %	0 %	20 %	257783816
39	NC_013203	TGT	2	6	1682	1687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783816
40	NC_013203	TGA	2	6	1691	1696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783816
41	NC_013203	ACG	2	6	1735	1740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783816
42	NC_013203	TTTA	2	8	1764	1771	25 %	75 %	0 %	0 %	257783816
43	NC_013203	TGCG	2	8	1804	1811	0 %	25 %	50 %	25 %	257783816
44	NC_013203	GCGTTT	2	12	1846	1857	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	257783816
45	NC_013203	TGA	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783816
46	NC_013203	TGC	2	6	1922	1927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783816
47	NC_013203	AAT	2	6	1938	1943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257783816
48	NC_013203	TTA	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783816
49	NC_013203	CGA	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783816
50	NC_013203	TCT	2	6	2017	2022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783816
51	NC_013203	TGA	2	6	2117	2122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783816
52	NC_013203	GTG	2	6	2143	2148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783816
53	NC_013203	TCT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783816
54	NC_013203	AAAG	2	8	2226	2233	75 %	0 %	25 %	0 %	257783816
55	NC_013203	TTC	2	6	2237	2242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783816
56	NC_013203	GAT	2	6	2253	2258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783816
57	NC_013203	AGA	2	6	2264	2269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
58	NC_013203	GAA	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
59	NC_013203	CGT	2	6	2421	2426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783816
60	NC_013203	AAG	2	6	2458	2463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
61	NC_013203	TTG	2	6	2500	2505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783816
62	NC_013203	TAA	2	6	2507	2512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257783816
63	NC_013203	TGG	2	6	2606	2611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783816
64	NC_013203	CAA	2	6	2623	2628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783816
65	NC_013203	GAA	2	6	2652	2657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
66	NC_013203	A	6	6	2656	2661	100 %	0 %	0 %	0 %	257783816
67	NC_013203	AGA	2	6	2666	2671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
68	NC_013203	AAG	2	6	2703	2708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783816
69	NC_013203	ACA	2	6	3036	3041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783817
70	NC_013203	TTCT	2	8	3049	3056	0 %	75 %	0 %	25 %	257783817
71	NC_013203	GCA	2	6	3135	3140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783817
72	NC_013203	GAA	2	6	3147	3152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783817
73	NC_013203	GTT	2	6	3165	3170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783817
74	NC_013203	TGC	2	6	3212	3217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783817
75	NC_013203	TTC	2	6	3418	3423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783817
76	NC_013203	ACA	2	6	3448	3453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783817
77	NC_013203	ATT	2	6	3540	3545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783817
78	NC_013203	ACG	2	6	3562	3567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783817
79	NC_013203	TC	3	6	3569	3574	0 %	50 %	0 %	50 %	257783817
80	NC_013203	AAC	2	6	3691	3696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783817
81	NC_013203	TTGATG	2	12	3802	3813	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	257783817
82	NC_013203	AAG	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783817
83	NC_013203	CTT	2	6	3841	3846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783817
84	NC_013203	CT	3	6	3899	3904	0 %	50 %	0 %	50 %	257783817
85	NC_013203	TG	3	6	3939	3944	0 %	50 %	50 %	0 %	257783817
86	NC_013203	TGC	2	6	3947	3952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783817
87	NC_013203	TCAAA	2	10	4009	4018	60 %	20 %	0 %	20 %	257783817
88	NC_013203	TCT	2	6	4040	4045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783817
89	NC_013203	TG	3	6	4077	4082	0 %	50 %	50 %	0 %	257783818
90	NC_013203	GTT	2	6	4120	4125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783818
91	NC_013203	AGAT	2	8	4138	4145	50 %	25 %	25 %	0 %	257783818
92	NC_013203	ACT	2	6	4158	4163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783818
93	NC_013203	A	6	6	4175	4180	100 %	0 %	0 %	0 %	257783818
94	NC_013203	TGC	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783818
95	NC_013203	CTT	2	6	4218	4223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783818
96	NC_013203	GACG	2	8	4314	4321	25 %	0 %	50 %	25 %	257783818
97	NC_013203	CAT	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783818
98	NC_013203	CGT	3	9	4353	4361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783818
99	NC_013203	A	6	6	4370	4375	100 %	0 %	0 %	0 %	257783818
100	NC_013203	GCA	2	6	4392	4397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783818
101	NC_013203	TGA	2	6	4436	4441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783818
102	NC_013203	GGT	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783818
103	NC_013203	CCG	2	6	4472	4477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257783818
104	NC_013203	GAA	2	6	4479	4484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783818
105	NC_013203	TGA	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783818
106	NC_013203	AT	3	6	4538	4543	50 %	50 %	0 %	0 %	257783818
107	NC_013203	GCT	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783818
108	NC_013203	TC	3	6	4616	4621	0 %	50 %	0 %	50 %	257783818
109	NC_013203	GAG	2	6	4633	4638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783818
110	NC_013203	TTC	3	9	4642	4650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783818
111	NC_013203	GC	3	6	4653	4658	0 %	0 %	50 %	50 %	257783818
112	NC_013203	TTTG	2	8	4664	4671	0 %	75 %	25 %	0 %	257783818
113	NC_013203	TGG	2	6	4715	4720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783818
114	NC_013203	TTC	2	6	4745	4750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783818
115	NC_013203	GA	3	6	4756	4761	50 %	0 %	50 %	0 %	257783818
116	NC_013203	AGA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783818
117	NC_013203	GAT	2	6	4830	4835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783818
118	NC_013203	GAT	2	6	4872	4877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783818
119	NC_013203	TGT	2	6	4940	4945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783818
120	NC_013203	AGA	2	6	4979	4984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783818
121	NC_013203	TAC	2	6	5005	5010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783818
122	NC_013203	GAT	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783818
123	NC_013203	TGAG	2	8	5026	5033	25 %	25 %	50 %	0 %	257783818
124	NC_013203	TAT	2	6	5057	5062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783818
125	NC_013203	ACC	2	6	5100	5105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257783818
126	NC_013203	GAG	2	6	5124	5129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783818
127	NC_013203	AAT	2	6	5167	5172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257783818
128	NC_013203	GTG	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783819
129	NC_013203	GAAAC	2	10	5198	5207	60 %	0 %	20 %	20 %	257783819
130	NC_013203	AC	3	6	5322	5327	50 %	0 %	0 %	50 %	257783819
131	NC_013203	TGAT	2	8	5405	5412	25 %	50 %	25 %	0 %	257783819
132	NC_013203	TTC	2	6	5526	5531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783819
133	NC_013203	GCAAG	2	10	5544	5553	40 %	0 %	40 %	20 %	257783819
134	NC_013203	A	7	7	5561	5567	100 %	0 %	0 %	0 %	257783819
135	NC_013203	TAC	2	6	5583	5588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783819
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383	NC_013203	AAG	2	6	19756	19761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783827
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